继南航和海航之后，昨(4)日国航、重庆航空以及东航也相继宣布与去哪儿网暂停合作，重航并关闭其在去哪儿网的旗舰店。截至1月4日，与去哪儿网断交的航空公司已经增加到南航、海航、首都航空（海航集团旗下）、重庆航空（南航子公司）、国航以及东航。
国航和东航在其官网发布公告表示，近期收到大量关于去哪儿网的旅客消费投诉，涉及加价销售机票、擅自变更机票使用条件、多收退票或改期费用及航班时间变更不通知等内容，损害了旅客权益。这与南航和海航的声明类似。
一位上海旅行社票务业者表示，让航空公司决定与去哪儿网断交并不容易，因为在去哪儿网和携程并购后，已经占据了机票销售管道65%以上的市场份额。目前的机票销售管道主要分为直销和分销两种，传统以来，各个航空公司的机票并非主要由航空公司直接销售，而是依靠大大小小的代理。比如说携程，传统意义上其实就是大代理，你在携程平台上每买一张机票，携程就能从航空公司获得一定的佣金，其他那些没有名气的机票代理赚钱的方式亦是如此。
事实上，近几年，航空公司也一直努力于实现提直降代(指提高直销比例，降低代理销售)，比如传统的代理销售机票获得的佣金，也从最高的10%以上降到了现在的零。
中小型代理商能够拿到的佣金变少了，但某些传统大代理，则通过与航空公司谈判增加后返奖励，弥补了代理佣金减少的损失。一些大代理为冲业务量赚取更多后返奖励，甚至会让利销售，自掏腰包补贴到票价中返利给消费者，所以这也是为何消费者通过机票代理买到的机票，还比航空公司直销价格便宜的原因。
去哪儿网跟携程等机票代理的模式则不一样，而是一开始就在搭平台，先是聚集了越来越多的机票代理在平台上进行销售，之后，海航、南航、东航等航空公司也开始陆续进驻去哪儿网的网站及移动端，以旗舰店的形式销售机票。所以在去哪儿的平台上既能看到各种代理卖的各个航空公司的机票，也能看到航空公司旗舰店形式销售的机票。
据了解，即使各大航空公司都以旗舰店形式入驻，其各自与去哪儿网的合作模式也都不同。比如有的航空公司不向去哪儿网缴纳任何费用，只将高舱位的机票通过平台销售，有的则以缴纳千分之几的技术服务费的形式，旗舰店连结到本公司的官网，销售政策与官网相同。
也由于去哪儿网为开放平台，各类机票代理也开始在平台上售票。近年来，消费者从去哪儿等平台上购买到无法报销的假机票、高于全价票的机票，支付远高于航空公司改签规定的退改签费用的投诉时有发生，而受骗后往往将责任怪罪于航空公司身上，此前去哪儿等平台也称，一直在努力改善监管方式，但还是很难从根本上杜绝。
事实上，不断压缩给机票代理的代理费以及与去哪儿网开战的背后，还有航空公司们希望夺回消费者的决心，据业者透露，目前传统航空公司只有25%左右的机票是通过直销卖出，这其中还包括通过去哪儿等OTA平台旗舰店销售的机票，最近几年，通过航空公司官网、APP、微信等平台加强直销，一直是航空公司们努力在做的。
也有业者表示，航空公司想加大直销并非易事。航空公司近年积极调整销售策略，包括增加电话等呼叫中心、网站销售和支付系统，但所有搭建所需要的需要成本和规模可能比支付给代理的佣金还要高，此外，很多成熟的机票代理商及OTA相比，航空公司的网站销售客户体验也相对逊色，比如退改签困难，没有酒店、租车，以及机票+酒店等丰富的一站式服务，这也是最近几年航空公司的机票直销比例上升并不如预期的主因
